Între 2001 şi 2006 au fost cercetate următoarele zone cu potenţial arheologic:

• Dealul Carpeni, Valea Nanului, zonele Hop-Găuri, Habad şi Tăul Ţapului, masivul Cetate, cât şi o campanie de cercetări perieghetice pe valea Cornei (2001);
• Dealul Carpeni, Tăul Găuri, Hop-Găuri, masivul Carnic, zona Gura Roşiei, întreaga vale Corna şi Taul Corna, Valea Saliştei (2002);
• dealul Carpeni, Tăul Găuri, masivul Jig-Vaidoaia, zonele Ţarina şi Gura Minei – Balmosesti (2003);
• Jig – Piciorag, Ţarina – continuarea cercetărilor în necropola romană de incineraţie identificată în campania 2003, zona Pârâul Porcului – Tăul Secuilor şi zona Tăul Anghel (2004);
• Ţarina – continuarea cercetărilor în necropola romana de incineraţie identificată în campania 2003 şi zona Pârâul Porcului – Tăul Secuilor, continuarea cercetărilor în necropola romană de incineraţie identificată în campania anterioară (2005);

• Pârâul Porcului – Tăul Secuilor – au fost continuate cercetările arheologice în zonă, în necropola romană de incineraţie identificată şi cercetată în campaniile anterioare (2006).
• Orlea (2007) – evaluare arheologică subteran şi suprafaţă.

Principalele rezultate arheologice de la suprafaţă (2001-2006):

• Identificarea şi cercetarea unor zone de habitat de epocă romană incluzând clădiri publice localizate pe dealul Carpeni şi în zona Tăul Ţapului;
• Localizarea unor aşezări de colonişti illiri situate în zonele Găuri-Hop şi Habad
• Identificarea şi cercetarea mai multor arii sacre situate în zonele Habad şi Valea Nanului, unde au fost descoperite peste 40 de altare votive epigrafe;
• Cercetarea a cinci necropole romane de incineraţie şi a două zone cu caracter funerar în punctele Hop (255 morminte), Valea Nanului (4 morminte), Carpeni (8 morminte), Taul Cornei (324 morminte), Jig-Piciorag (34 morminte), Ţarina (495 de morminte) şi Pârâul Porcului – Tăul Secuilor (310 morminte cercetate până în prezent), unde au fost descoperite peste 1.430 de complexe funerare – unul dintre cele mai ample loturi de materiale şi informaţii asupra practicilor funerare în provincia Dacia.
• Descoperirea în zona Tăul Găuri a monumentului funerar circular din sec. II-III p. Chr.; monumentul este conservat în situ, fiind luate masuri de conservare primară şi protectie permanentă (toate fondurile legate de conservarea şi protejarea monumentului fiind asigurate, conform legii de S.C. Roşia Montană Gold Corporation S.A.).
• Investigarea unor zone de prelucrare primară a minereului aurifer (Jig-Piciorag, Habad).